¡Hola!
Situación explicada rápidament: Si te descargas un assembly directamente desde internet, y añades una referencia a dicho assembly, la referencia te aparecerá como añadida, pero VS no hará caso de ella. Cuando compiles te aparecerá un error parecido a:
Unable to load the metadata for assembly 'AvalonDock'. This assembly may have been downloaded from the web. See http://go.microsoft.com/fwlink/?LinkId=179545; The following error was encountered during load: Could not load file or assembly 'AvalonDock, Version=1.2.2691.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=85a1e0ada7ec13e4' or one of its dependencies. Operation is not supported. (Exception from HRESULT: 0x80131515)